苜蓿黄萎病危害苜蓿、马铃薯、啤酒花、草莓、烟草、茄子、大豆、花生、红豆等经济作物和牧草。1996年，在新疆阿克苏地区温宿县托乎拉乡首次发现疫情。2000年～2001年，实施大规模农业植物有害生物疫情普查，在阿克苏、巴音郭楞、伊犁、阿勒泰4地(州)新发现39个疫情发生点。目前，该病发生范围仅限于南北疆的4地(州)9个县(市)、35个乡镇的37个村的苜蓿作物上，共有疫情发生点39个。
　　
　　1　苜蓿黄萎病的危害性
　　
　　新疆苜蓿栽培面积已达25万hm²，居全国第二。苜蓿是全区农牧业生产的支柱，一旦苜蓿黄萎病发生，极易引起作物间的交叉感染，直接威胁畜牧业发展和其他作物生产。据估算，疫情一旦扩展蔓延，新疆每年至少造成上亿元的经济损失，且无法消除后患。
　　
　　2　采取农业防治措施
　　
　　2．1　拔除零星发病株对零星发生病株的田块，进行拔除、挖走病土，集中在非作物区深埋。
　　2．2　实行轮作倒茬对疫情发生点田块，由当地政府组织农户进行翻种(深度达50cm以下)，实行轮作倒茬。选择种植小麦、玉米、油菜、油葵、高粱、亚麻、辣椒等非寄主作物，不宜种植棉花、马铃薯、啤酒花、甜菜、番茄、瓜类等作物。
　　2．3　实行水旱轮作苜蓿作物与水稻进行轮作是防治苜蓿黄萎病最有效的一种技术措施，在阿克苏、巴音郭楞和伊犁苜蓿黄萎病发生点实行两年以上的水旱轮作，彻底根除苜蓿黄萎病的发生。
　　2．4　采取田间化防措施
　　2．4．1　种子处理使用阿西米达悬浮液杀菌剂，开展田间防治，以每100kg种子使用阿西米达商品剂量100～200mL进行种子药剂拌种。
　　2．4．2　土壤处理对病点土壤处理采用氯化苦熏蒸剂进行熏蒸，施药时，先在病点打孔9～12个/m²，孔深20cm，孔距20cm，每孔用吸管注药10ml，然后用土封闭孔口。
　　
　　3　开展苜蓿抗病性研究
　　
　　在疫情监测的基础上，查清苜蓿种子的主要来源和品种，在重病点建立小型苜蓿黄萎病试验点，进行抗病性试验，筛选出品质好、产率量高、抗病性强、适应我区种植的苜蓿新品种。
　　
　　4　防控效果
　　
　　我区发现苜蓿黄萎病后，采取了加强检疫执法，行政管理、农业防治和化学防治等综合控制措施，遏制了病害的蔓延。目前，该病害已基本得到控制。在后续跟踪监测中一直未发现病株。