除草剂仓库应设在交通方便、地势干燥、排水良好的地方，要远离居民饲养场、食品库等地。仓库要求通风、阴凉、防潮。夏季防止高温、曝晒；雨季防止漏雨和潮气腐蚀包装；冬季库温不得低于所贮藏除草剂要求的最低临界温度，以免有效成分因结晶、沉淀或结冻而受到影响，挥发性除草剂库温最好不低于0℃，以免某些药剂在低温下变质或失效。水剂要避免结冻和涨坏包装。仓库内要配置通风散热设备和消防器材等，以防万一。
　　除草剂贮存时，要按品种、剂型、作用、使用时期分类排列，正向放置。贮存中如存放过久，要适当进行倒位，检查药物是否变质和包装有无损坏。不能将除草剂与食品、香烟、医药、种子、种苗、炸药、鞭炮、雷管、导火线、易燃易爆或强酸强求碱等物品混存，以确保安全与防止污染。
　　保管除草剂要按库存分别上帐，并定期清点与核对。入库、出库应严格履行手续。在不同除草剂存放的位置上，应分立标牌或挂卡。如有药品过期或其它问题，要及时反映情况，提醒主管人员注意。库存除草剂的标签要求完整，发现损坏丢失，要立即补贴齐全。贮存只有外文标签的进口除草剂，为便于管理，要加贴中文标识。
　　除草剂货台与仓库远离火种，确保安全。清出仓库的失效根废除草剂和装箱填充物、垃圾等，要深埋，切勿乱扔乱倒，避免人、畜禽、鱼类或景观植物接触中毒或受害。
　　保管员应提高除草剂包储业务技术水平，了解商品性能、鉴别方法、保管方法以及消防的基本知识，熟悉消防器材的使用和维修等。