柑橘属果树是全球种植最广的果树之一，然而关于柑橘属果树的起源和进化历史仍不清楚。不同学者对柑橘属物种的概念理解各有不同，分歧很大，部分原因是本属植物的生殖与繁殖方式较特殊，大多又是栽培种，而很多栽培种的野生祖先已不存在，使得解决柑橘属物种的问题更为复杂。

Proposed origin of citrus and ancient dispersal routes.

2018年2月8日，来自美国能源部联合基因组研究所、佛罗里达大学、加州大学以及西班牙瓦伦西亚农业研究所等多个团队合作在Nature在线发表了题为“Genomics of the origin and evolution of Citrus”的研究论文。该研究通过基因组学分析、系统发育分析以及生物地理学分析，揭示了柑橘属植物的起源、进化以及驯化历史。

该研究分析了已发表的柑橘属果树的基因组和30种本研究新测序的基因组（共60种不同材料的基因组，包括澳洲青柠和美女桔），发现当今的柑橘属果树至少源于10种柑橘物种。柑橘物种的多样化发生在大约600-800万年前的中新世晚期，并快速在东南亚传播，并且发现这与亚洲夏季季风减弱相关。澳洲柑橘多样化开始的更晚一些，大约是在400万年前越过华莱士线（亚洲与澳大利亚的过渡区）。同时，对野生柑橘的驯化研究发现，柚子的基因可能也对橘子有所贡献。该研究为柑橘的分类和系统发育研究提供了新的参考。

Genetic relatedness among 48 citrus accessions derived from four progenitor species including citrons, pummelos, pure mandarins and micrantha.

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