百脉根LBD基因电子表达谱和部分基因表达验证
2016/8/30 

  LATERAL ORGAN BOUNDARIES DOMAIN (LBD) 基因家族是在拟南芥中发现的高等植物所特有的一类基因,其编码的蛋白中含有LATERAL ORGAN BOUNDARIES (LOB) 结构域。根据LBD蛋白结构中是否含有亮氨酸拉链类似基序,将LBD基因分为两类:第一类(class ILBD蛋白结构域中包含完整的亮氨酸拉链基序;第二类 (class II) LBD蛋白结构域中不包含亮氨酸拉链基序。LBD基因一般在侧生器官与茎尖分生组织的边界处、侧生器官的近轴一侧的基部表达,并呈现出在多种组织内特异表达的特征。在豆科模式植物蒺藜苜蓿和百脉根中,LBD基因控制其叶枕的发育,这为我们进一步探索LBD基因功能提供了新的认识。  

  版纳植物园植物功能基因研究组的博士研究生阳天泉,在蒺藜苜蓿和百脉根全基因组水平筛选和鉴定LBD基因家族,并对基因结构、系统进化、进化压力、染色体定位以及基因表达模式进行了分析。在蒺藜苜蓿和百脉根中分别鉴定到57个和38LBD基因,它们在染色体中呈不均匀分布。该家族基因结构简单,多为1-2个外显子。对百脉根LBD基因表达模式分析显示,LjLBD1 LjLBD6 LjLBD11LjLBD32在复叶中具有较高表达。酵母双杂交显示LjLBD6LjLBD11存在体外互作,可能暗示LjLBD11LjLBD6共同调控复叶发育。  

  该研究成果以Genome-Wide Identification, Evolutionary Analysis and Expression Profiles of LATERAL ORGAN BOUNDARIES DOMAIN Gene Family in Lotus japonicas and Medicago truncatula为题,发表于PLOS ONE  

  本研究得到了国家自然科学基金(31500989)的资助,在此表示感谢。 

 

  百脉根LBD基因电子表达谱和部分基因表达验证