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樟科植物系统发育基因组学研究获进展

【PDF原文: Comparative chloroplast genomics and phylogenetics of nine Lindera species (Lauraceae)

  樟科山胡椒属树种经济用途广泛。山胡椒属多数种类的种子富含脂肪,可供制皂及工业油用,如油料植物山胡椒(Lindera glauca);不少种类富含芳香油,可制香料及药用,如中草药三桠乌药(Lindera obtusiloba);一些种类的木材有香气,可供家具及文体用品等用,如缅甸著名木材黄金樟的树种山香果(Lindera metcalfiana)。然而,目前对于山胡椒属的物种界定是否合适尚存争议,尤其是山胡椒属、木姜子属和月桂属等的系统关系还不明确。版纳植物园博士研究生赵美丽及其合作者在宋钰副研究员和徐增富研究员的指导下,利用32种樟科植物的叶绿体基因组探讨了山胡椒属植物与其它10属植物的系统关系。 

  新测序的山胡椒属植物叶绿体基因组大小为152211 bp至152968 bp,与潺槁木姜子(Litsea glutinosa152618 bp)及月桂(Laurus nobilis 152750 bp)的叶绿体基因组大小相近。利用叶绿体基因组全序列构建的系统进化树表明:山胡椒属的黑壳楠(Lindera megaphylla)和潺槁木姜子及月桂形成一组,与香叶树(Lindera communis),山胡椒和绒毛山胡椒(Lindera nacusua )形成第一分支;其余五种山胡椒属的北美山胡椒(Lindera benzoin ),团香果(Lindera latifolia),山香果,三桠乌药和海南山胡椒(Lindera robusta)形成第二分支;两个分支构成的属群与由樟属、檫木属和甘蜜树属组成的属群相邻近;增加已公布条形码数据的山胡椒属植物后,第二分支可进一步再分为三组。上述结果确认了山胡椒属为复系类群,提示山胡椒属所处的属群需要分类修订。 

  该成果以Comparative chloroplast genomics and phylogenetics of nine Lindera species (Lauraceae)为题,近日发表于国际期刊Scientific Reports。该研究得到了国家自然科学基金委(31600531),中国科学院“西部之光”(Y7XB061B01)和中科院东南亚生物多样性研究中心(Y4ZK111B01)等项目的资助。 

基于32种樟科植物叶绿体基因组全序列构建的系统进化树

【PDF原文: Comparative chloroplast genomics and phylogenetics of nine Lindera species (Lauraceae)

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