温度是影响种子贮藏质量的重要因素。多年实践证实，小麦种子温度在20℃以下，水分在12.5%以下，可确保安全贮藏；种子温度超过25℃，水分在14%  以上，就会使种子呼吸旺盛，引起种堆发热，生活力下降，种用价值降低。贮藏种子要坚持种子温度检测，种子温度的检测一般掌握在入仓后的三个月即6～8 月，每月监测三次，9月后每月监测两次。在仓库不同部位设三点，分中下两层（中2个点，下1个点）测量、记载，并对照气温、仓温进行比较、分析。夏秋季气温大于种温大于仓温，秋冬季种温大于仓温大于气温。如果夏季种温高于气温，说明种子已明显发热，需立即采取翻仓、出晒等措施，以防不必要的损失。