大豆含有较高的油分和非常丰富的蛋白质，较难贮藏。长期安全贮水分含量必须达12％以下，最好在9-10％之间，超过13％有霉变危险。入仓前要将破损粒、冻伤粒、虫蛀粒和病变粒剔除干净，提高贮藏稳定性。入仓后经过一段时间，种子进行后热作用，放出大量湿气和热量，即入仓后3-4周左右，应趁晴天进行倒仓通风散湿，结合过筛除杂，防霉变。